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张建华团队报道水稻花器官全基因组染色质可及性图谱

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发表时间:2023-12-10 16:47作者:伊斯通生物科技


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      该研究是香港浸会大学/香港中文大学农业生物技术国家重点实验张建华教授团队完成并发表于Plant Physiology 上,标题为 "The chromatin accessibility landscape of pistils and anthers in rice"


  这一研究利用了 ATAC-seq技术,对水稻幼穗、花药和雌蕊进行了开放染色质位点的图谱绘制。结果发现,与花药相比,雌蕊中具有更多的开放染色质位点。幼穗的开放染色质密度低于花药和雌蕊。结合转录组和染色质组蛋白的 ChIP-seq分析,发现水稻花的开放染色质与基因表达以及组蛋白修饰之间存在着内在联系。另外,建立了雌蕊中特异表达的转录因子的调控网络,为雌蕊发育提供了一个新工具。

   研究人员通过还提出来了一种预测转录因子结合位点的策略。也建立了低温响应的调控元件网络。为更全面的理解水稻生殖发育和低温响应提供了新的工具和资源。


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