近日,一项发表于《Molecular Plant》的重磅研究通过解析 17 个二倍体被子植物的 400 余个完整
着丝粒,揭开了这一 “进化悖论” 的核心机制 —— 着丝粒在维持关键功能的同时,通过卫星重复序列与转座子的动态博弈,驱动基因组创新与物种分化,为植物进化生物学与分子育种提供了全新视角。
研究团队整合 1.8 亿年分化历史的被子植物数据,发现着丝粒大小变异跨度达 277 倍(0.02-5.53 Mb),从拟南芥的严格调控(1.33 倍变异)到马铃薯的极端灵活(82 倍变异),展现出谱系特异性进化约束(图 1)。值得关注的是,着丝粒结构并非单一模式,而是经历了从 “卫星主导的简单结构” 到 “卫星 - 转座子共富集的复杂结构” 的梯度转变:拟南芥着丝粒卫星占比超 80%,玉米则以转座子为主(78.45%),而蓝星睡莲等基部类群甚至不含特异性卫星重复,暗示卫星序列可能在不同谱系中独立起源。这种结构多样性与基因组大小弱相关,但与 CENH3 结合区域的相关性显著增强(R²=0.50),凸显表观遗传调控的核心作用。
研究首次证实,卫星重复序列与转座子是着丝粒进化的 “双核心驱动力”。卫星重复序列以 100-200 bp 单体为主流(适配 CENH3 核小体结合),但也存在 666 bp(东北马兜铃)等特殊类型,其拷贝数与均一化程度直接影响着丝粒稳定性(图 3)。而转座子(尤其是 Gypsy 超家族)的插入模式则是结构变异的关键:频繁插入会碎片化卫星阵列,降低均一化效率,推动着丝粒快速分化;高粱等物种的古老转座子保留则塑造了稳定的着丝粒结构。更令人意外的是,转座子可作为 CENH3 结合的替代支架,在卫星缺乏型着丝粒中形成规整核小体阵列,展现出 “功能补偿” 能力。
种群水平分析揭示,着丝粒是物种内遗传多样性的 “热点区域”:葡萄不同材料的着丝粒大小差异近 8 倍,卫星链取向的染色体特异性偏倚在物种间差异显著(高粱一致性 95%)。而跨物种时序重建显示,着丝粒重复序列的分化遵循 “渐进 - 爆发” 模式:近期分化(<5 百万年)的玉米物种共享 CentZea156 卫星;中期分化(5-10 百万年)的拟南芥属出现物种特异性卫星谱系;远期分化(>10 百万年)的稻属甚至发生卫星完全周转(GG 基因组丢失所有卫星)。这种分化常伴随核型重排,为物种形成提供了 “基因组隔离屏障”。
该研究构建的 “基因组进化 - 染色体重排 - 选择压力” 统一框架,不仅破解了着丝粒 “功能保守与序列快速进化” 的悖论,更为作物育种提供了新思路 —— 通过调控着丝粒相关重复元件,可优化染色体稳定性与遗传重组效率。未来,结合 T2T 测序与表观遗传分析,有望进一步解析着丝粒进化的分子机制,为作物抗逆、高产等性状改良开辟新路径。这一突破性成果,无疑将推动植物进化生物学与分子育种领域的跨越式发展。
